Medan Ash anländer spänd av förväntan till Unova-regionen, med Pikachu, sin mamma och professor Oak, upptäcker vi samtidigt att Giovanni har gett Team Rocket ett viktigt uppdrag i Unova-regionen också. Medan Jesse, James och Meowth förbereder för sitt nya uppdrag, introducerar professor Oak Ash för professor Juniper, en av de ledande forskarna i Unova-regionen.
Plötsligt dyker ett mörkt åskmoln upp och Pikachu träffas med en massiv mängd elektricitet. Efter att ha undersökt Pikachu, verkar professor Juniper inledningsvis inte kunna hitta något som är fel. Men senare, när Ash strider mot en lovande ny tränare vid namn Trip och hans nybörjar-Pokémon Snivy, kan Pikachu inte använda några Elektrisk-typ moves!
Tillbaka i professor Junipers labb, upptäcker vi att Pikachu faktiskt har blivit påverkad av en massiv mängd elektricitet, som absorberades under åskstormen. Då dyker plötsligt samma moln upp igen! Då återberättar professor Juniper legenden om den Legendariska Pokémon Zekrom och detta gör så att alla undrar exakt vad det är som orsakade Pikachus mystiska förlust av Elektrisk-typ krafter. Kommer Pikachu någonsin kunna använda de där krafterna igen!?
