Sankareidemme palatessa Driftveil Cityn salille ja Ashin haastaessa taas salijohtaja Clayn saliotteluun, he saavat kuulla että Clay on vieläkin liian kiireinen Ashin haastetta varten, sillä elvytysyrtit ovat loppuneet. Clay käskee Ashin tuoda elvytysyrttejä ennen kuin hän hyväksyisi haasteen. Siispä sankarimme suuntaavat kohti toria löytäkseen yrttejä. Heidän ystävänsä Charles tarjoutuu auttamaan, mutta turhaan, sillä elvytysyrttejä kasvaa vain Milos-saarella. Saavuttuaan sinne, sankarimme saavat selville, että nuorukainen nimeltään Lewis voisi auttaa heitä. Matkustettuaan pitkään löytääkseen hänet, Lewis kuitenkin kertoo pettymykseksi ettei hänkään löydä elvytysyrttejä; sateeton jakso on jatkunut kauan ja kaikki yrtit ovat kuivuneet.
Lewis ja Gothorita suorittavat sateentekoseremonian legendaarisen Landorus-pokémonin alttarilla. Sen sijaan paikalle ilmestyykin kaksi vihaista legendaarista pokémonia, Tornadus ja Thundurus! Niiden paluu Milos-saarelle oli estetty kahdella suojaobeliskilla, mutta Rakettiryhmän tuhottua ne Tornadus ja Thundurus aloittavat taistelunsa uudestaan uhaten Milos-saaren olemassaoloa!
Sankarimme yrittävät urheasti vastustaa Tornadusta ja Thundurusta, mutta vihaiset legendaariset pokémonit ovat liian voimakkaita. Lopulta Lewis sanoo että vain naispuolinen alttarineito voi kommunikoida telepaattisestiLandoruksen kanssa. Landorus keskeytti muinaisina aikoina Tornaduksen ja Thunduruksen taistelun. Iris ryhtyy alttarineidoksi ja jätämme sankarimme juuri kun Iris yrittää yhteydenottoa legendaarisen pokémonin, Landaruksen kanssa pelastaakseen Milos-saaren.
