När de tränar i skogen stöter våra hjältar plötsligt på en mystisk flicka som sover i en båt som håller på att åka ut över ett vattenfall! Brock är snabbtänkt och dyker i vattnet och räddar henne. Därefter ber hon Brock att ta med henne över berget för att hitta en ”hemlig trädgård”.
Även om den unga flickan, Marley, till en början är mycket hemlighetsfull, förklarar hon att hon tar hand om en sjuk Shaymin. Det visar sig att den hade blivit utsatt för något slags gift under en attack från en Seviper – Team Rockets Seviper! De hade försökt stjäla Shaymin från Marley kvällen innan och under natten, och dyker på nytt upp för att slutföra dådet. Men de misslyckas totalt tre gånger, och våra hjältar och Marley ser till att de drar iväg igen.
Marley har försökt få Shaymin att transformeras till Sky Forme, så att den kunde genomföra sin Blomsterbäringsresa, men Shaymin har velat stanna kvar hos henne – tills nu. Efter att de hittat en av de sista kvarvarande Gracidea-blommorna som står i blom på ett fält, uppnår Shaymin slutligen Sky Forme efter att tidigare ha misslyckats, och tar sedan ett kärt farväl av Marley och våra hjältar när den hittar två andra Shaymin i Sky Forme att slå följe med.
