Op zoek naar Team Flare en Gompie, ontdekt Team Rocket een Pokémon die er net zo uitziet, die bekend staat als Z2.. en Team Flare zit hem op de hielen! De twee teams strijden met elkaar en Z2 valt steeds in andere handen, totdat hij samensmelt met vele Cellen en een krachtige, bedreigende serpentine Pokémon wordt, die de aarde doet schokken met zijn aanval!
Z2 is duidelijk in het voordeel, maar Lysandre heeft om versterking gevraagd. Met hulp van Alain en zijn Mega Charizard, dwingt Team Flare Z2 tot stilstand en sluit hem op in een kooi.
Bij de kampeerplaats van onze helden, knuffelt Bonnie ondertussen een treurige en bezorgde Gompie, en probeert erachter te komen wat er mis is.
