Durante una pausa pranzo i nostri eroi restano felicemente sorpresi dall’apparizione del loro vecchio amico Sanpei con il suo Greninja che sta facendo ritorno al Villaggio Ninja e li invita a visitarlo.

Lì incontrano i suoi fratelli: Ippei e Nihei, e anche il capo del villaggio Hanzo e la sua assistente Shinobu. Tutti restano impressionati dai progressi fatti da Sanpei, sia come ninja che come Allenatore. I nostri eroi restano meravigliati da tutti i fantastici Pokémon del villaggio... mentre il Team Rocket, spiandoli dall’alto, trama di catturarli tutti. Dal nulla sbucano numerosi Skarmory che attaccano il villaggio e un gruppo di ninja mascherati porta via con sé il capo del villaggio Hanzo. Chi sono e che intenzioni avranno? La risposta arriverà presto… il viaggio continua!