Como nuestros héroes están en Ciudad Luminalia, Serena sugiere ir a visitar al Profesor Ciprés antes de continuar el viaje y ha hecho unos deliciosos macarons para la ocasión. En el Laboratorio del Profesor, se sientan con una rica taza de té, cuando de repente descubren que los macarons han desaparecido. Por fin encuentran la cesta de golosinas en un rincón y protegida por un Chespin goloso que no piensa compartir.

Mientras tanto, el Team Rocket ha estado investigando sobre los estudios del Profesor Ciprés sobre la megaevolución y los villanos deciden que robarle la información sobre dicha investigación daría un gran impulso a sus planes. Irrumpen en las instalaciones del laboratorio, raptan al Profesor y le arrojan a la parte trasera de su camión. Clem y Serena consiguen colarse a bordo antes de que arranquen. Las niñas se quedan encerradas dentro por accidente, pero Serena deja una pista de trocitos de macarons que Chespin rastrea rápidamente, llevando a Lem y a Ash hasta la guarida de los villanos.

Mientras tanto, James ha insertado los datos del Profesor Ciprés a un Mega-Mega-Meowth mecánico que ataca a nuestros héroes. Chespin le hace saber a Lem que quiere combatir, pero ni Chespin ni Pikachu pueden con la grandiosa máquina. Justo entonces, el Mega-Blaziken que rescató a Ash, cuando se cayó de la Torre Prisma, reaparece junto a su Entrenador, un hombre misterioso con una máscara de Blaziken.

El increíblemente potente Lanzallamas de Blaziken deja a Mega-Mega-Meowth carbonizado junto al auténtico Meowth, que era quien lo controlaba, y el Team Rocket es enviado a despegar de nuevo. Mientras nuestros héroes vuelven al laboratorio con el Profesor, el Entrenador de Mega-Blaziken los sigue protegiendo, ahora sin la máscara. Se trata de Meyer, el papá de Lem y de Clem.

Ya en el laboratorio, Ash, Serena, Lem y Clem se disponen a despedirse, cuando Clem se da cuenta de que Chespin los observa. Lem agradece al Pokémon su ayuda en la lucha contra el Team Rocket y le dice que pronto volverán a verse, pero está muy claro que Chespin quiere acompañarles. Así que con Chespin, el nuevo amigo de Lem, formando parte del grupo, el viaje a Ciudad Relieve continúa.