Team Plasma jobber fortsatt med sin onde plan, å fange Pokémon for å bruke dem som forsøks-objekter i et eksperiment som har verdensherredømme som mål. To tilhengere, Schwartz og Weiss, har fanget en Braviary og kjører den tilbake til hovedkvarteret, men de møter på en veisperring, plassert der av N. I forvirringen som oppstår, åpner N lasterommet og slipper fri Braviary, og de rømmer sammen, men de har begge blitt skadet, og Braviary har en skjult sporings-enhet festet til nakken.
I mellomtiden er våre helter på vei til De hvite ruiner, og på veien møter de det skadde paret. De drar til Pokémon-senteret, hvor Nurse Joy bandasjerer den skadde vingen til Braviary. I løpet av et mystisk strømbrudd forårsaket av Team Plasma, oppdager N sporings-enheten, og skjønner at han må få Braviary vekk derfra fort. Han forklarer planen for Ash og de andre, og de setter i gang. Schwartz og Weiss jakter på signalet fra sporings-enheten, men de oppdager raskt at det bare er N som opptrer som lokkemat for å distrahere dem mens Ash, Iris og Cilan får Braviary i sikkerhet.
Men Braviary føler at N er i fare, og strever og roper helt til våre helter skjønner hva det er. De kommer fram til N i siste liten, for N blir angrepet av tilhengerne sine Pokémon. Ash vet at N misliker Pokémon-kamper, det det ser ikke ut til at de har noe valg, og snart er kampen i gang; Zangoose og Seviper på skurkenes side mot Ash sin Pikachu og Iris sin Excadrill, med litt hjelp fra den ville Braviary, som resulterer i at våre helter vinner. Schwartz og Weiss flykter, og lover seg selv å fange Braviary en annen dag.
Endelig kan Braviary vende tilbake til naturen, og våre helter kan fortsette reisen, men denne gangen.. bli N med dem!
