Onze helden zijn terug op Melemele Eiland, nadat ze hun onderzoeksprojecten op Poni Eiland hebben afgerond en hebben niet door dat er een paar kleine, mysterieuze Pokémon met ze is meegegaan. Zodra ze ontdekken dat deze Pokémon graag metaal eten, en ze dus het gereedschap van de Pokémon School, Team Rocket's onderdelen en de kostbare doppen-verzameling van James hebben opgegeten, is Rotom vastbesloten om veel nieuwe data van deze nieuwe soort Pokémon vast te leggen. Ash geeft deze informatie aan Professor Oak en die zegt dat deze mysterieuze Pokémon inderdaad een ongelofelijke ontdekking is!