Nadat onze helden in Castelia City, waar ook de Castelia City Gym ligt, zijn gearriveerd, besluiten ze op onderzoek uit te gaan en komen ze Burgh, de Castelia City Gym Leader, tegen. Samen ontdekken ze ondergronds een Venipede in nood en natuurlijk wil Ash hem helpen. Maar terwijl ze daarmee bezig zijn, ontdekken ze dat de hele stad overspoeld wordt door een gigantische kolonie van nijdige Venipede!
De mensen zijn in paniek en de burgemeester van Castelia City stelt vast dat er onmiddellijk iets moet worden gedaan. Maar als onze helden Trip (de rivaal van Ash) tegenkomen, zien ze dat hij tegen ze wil vechten en wegjagen. Burgh stelt voor de Venipede naar het Stadsplein te leiden, terwijl Professor Juniper onderzoekt hoe dit heeft kunnen gebeuren en opgelost kan worden. De Venipede worden bijeen gedreven en naar het Stadsplein gebracht. En wanneer Professor Juniper een grote energiebron in het Woestijn Resort ontdekt, gaat ze samen met onze helden en Agent Jenny er naartoe om precies uit te zoeken wat daar aan de hand is. Burgh blijft achter om zich over de Venipede te ontfermen.
