Zo snel als Pikachu een mysterieuze kwaal opgelopen had, die effect had op al zijn Elektrisch soort zetten, zo snel bracht een tweede onweersbui volledige genezing! Professor Oak en Professor Juniper wijten de problemen aan de acties van de Legendarische Pokémon Zekrom, en zijn het erover eens dat verder onderzoek noodzakelijk is. Ondertussen is Team Rocket aangekomen in de Unova regio, en bereidt zich voor om een operatie te beginnen met het doel om Pikachu en Zekrom beide te stelen. Ash heeft besloten om zijn reis te vervolgen in de Unova regio en dus, gewapend met een nieuwe Pokédex en nieuwe Poké Ball, trekt onze held erop uit om zoveel mogelijk nieuwe Unova regio Pokémon te ontdekken. Onderweg komt hij Iris tegen en haar Pokémon Axew, net als hij bezig is om zijn eerste Unova regio Pokémon Pidove te vangen. Al snel hierna verschijnt Team Rocket ten tonele met hun kwaadaardige plan en steelt Pikachu, Pidove en Axew! Natuurlijk laat Ash het er niet bij zitten en komt hij meteen in actie tegen zijn oude vijanden Jessie, James en Meowth. Met wat onverwachte hulp van Oshawott, die eerst een verlegen Pokémon leek te zijn en die Ash en Pikachu had gevolgd, krijgen Ash en Iris hun Pokémon veilig terug, terwijl Team Rocket geheimzinnig verdwijnt.
Na een bezoek aan het Pokémon Center, waar Pikachu, Axew en Pidove door Zuster Joy in goede gezondheid worden gebracht, geeft Iris toe dat, hoewel Ash zich gedraagt als een ‘klein kind’, ze onder de indruk is door de manier waarop hij in actie kwam bij het redden van hun drie Pokémon. Ash vraagt zich hardop af waarom Oshawott hen op die manier heeft geholpen…
