Un'ombra incombe su Ash, Vera e i loro amici mentre proseguono il viaggio attraverso la regione di Hoenn, e non è quella del Monte Camino. Il Team Magma e il Team Idro stanno cercando di incastrare i nostri eroi! Sfuggiti ai piani nemici, Ash e Vera si concentrano sui propri obiettivi personali: Ash combatte per conquistare altre tre Medaglie e Vera ottiene i suoi primi tre Fiocchi. Il gruppo accoglie anche nuovi Pokémon, come Torkoal e Bulbasaur, ma se fossero troppi da gestire?