Jessie, James, Miaouss et Qulbutoké ont une grosse surprise quand Cadoizo arrive du siège de la Team Rocket et leur livre leurs amis Pokémon ! Après d’agréables retrouvailles, ils inventent une ruse pour voler Pikachu. Feignant de fuir la Team Rocket, le Mime Jr. de James trompe Sacha, Ondine et Pierre, mais Pikachu n’est pas dupe. Les autres Pokémon de la Team Rocket ont réussi à séparer nos héros, laissant Pikachu tout seul, mais Sacha et ses amis arrivent juste à temps, ainsi que Latias ! Elle aide à vaincre la Team Rocket, puis montre à nos héros une vision d’un Latios en danger. Pendant ce temps, les Pokémon de la Team Rocket commencent à paniquer, en voyant que Jessie, James et Miaouss se séparent…