Da en mystisk Pokémon stjæler Halas Z-krystal, skrider Ultravogterne til handling - selvom det er midt om natten! Desværre kommer de tomhændede tilbage, men næste dag kan Lusamine fortælle dem, at de søger et Ultra Beast ved navn Pheromosa. Pheromosa er fascineret af Z-krystaller, og den har allerede stjålet adskillige fra intetanende Trænere. Da den stjæler Team Rockets Z-krystaller, er Meowth ikke til nogen verdens hjælp - den er nemlig dybt betaget af tyven! Det bliver dog snart tydeligt, at Pheromosa kun tænker på Z-krystaller, og det knuser Meowths hjerte, så den vender atter tilbage til sine venner... også Bewear, som uforvarende kommer til at hjælpe Ultravogterne med at sende Pheromosa tilbage til dens verden!