Mens Team Plasma fortsætter iværksættelsen af deres onde plan om at stjæle Lysstenen og fange N, og Ash og N er fanget under jorden, kæmper Cilan og Iris en hård kamp. N kan mærke rystelserne på overfladen, mens han kan høre lyden af hans Pokémon-venner, der skriger af rædsel.
Ash beslutter, at de er nødt til at komme ud derfra for at hjælpe de andre og husker en af professor Cedric Junipers eventyrregler: Giv ikke op før til allersidst! Og mens N ser forbløffet til, kalder Ash på resten af sine Pokémon, så de sammen kan grave en tunnel op til overfladen. N imponeres af båndene imellem dem.
Imens har Colress igen aktiveret sit Pokémon-kontrolapparat, hvilket tvinger Cilan og Iris til at sende Crustle og Dragonite tilbage til deres Poké Balls, så apparatet ikke kan kontrollere dem. Det gør dem yderst sårbare, og Team Plasma tager dem straks til fange! Aldith vil have Colress til at sende de hjernevaskede Pokémon under jorden efter N og Lysstenen – men lige i det øjeblik bryder Krookodile gennem jorden hurtigt efterfulgt af Charizard, Ash og N, der har Lysstenen!
Colress får nu sit apparat til at sigte efter Ash’ Pokémon, men Ash skynder sig at få dem i sikkerhed… alle pånær Pikachu, som har en velkendt modvilje mod sin Poké Ball. Colress’ apparat får kontrol over den, og en snerrende Pikachu vender sig for at angribe vore helte. Nu forsøger Ash blidt at få sin bedste ven til at genkende ham, men der virker ikke, og for fuld kraft udløser Pikachu en Thunderbolt mod Ash på tæt hold, hvilket slår ham bevidstløs.
N tilbyder nu desperat at overgive sig – sammen med Lysstenen – hvis Colress til gengæld slukker for sit apparat og slipper Pikachu fri. Det går han med til, og N bliver pågrebet af Team Plasma. Samtidig bliver Pikachu sig selv igen og putter sig ind til den sårede Ash. Snart ankommer Ghetsis og afslører sit ultimative mål: at hidkalde Den Legendariske Pokémon Reshiram fra Lysstenen og tage kontrol over dens hjerne! Kan vore helte nå at stoppe de lumske planer, før det er for sent?
