Team Rockets plan om at stjæle alle Pokémon er stadig i fuld gang, og vores helte samt Ingo og Emmet er i skarp forfølgelse! De møder hele tiden forhindringer, men pludselig kommer Cilan i tanke om, at Spøgelsestoget er nødt til at komme op af undergrunden på et eller andet tidspunkt, og den eneste udgang fører mod Anville Town. I mellemtiden har vores heltes tilfangetagne Pokémon forsøgt at flygte fra Spøgelsestoget, og med en kombineret indsats fra Pikachu, Snivy, Excadrill, Roggenrola, Tepig og Pansage lykkes det dem at slippe ud af deres bur. De får sammen med vores helte samt Ingo og Emmet koblet vognen fra Soøgelsetoget. I sidste ende, kan ikke engang Dr. Zager fra hans helikopter gøre noget noget for at redde Team Rockets planer.
Selvom Pikachu er rasende over, at Meowth hele tiden havde snydt dem, fortæller Ash Meowth, at han virkelig har nydt deres tid sammen. Team Rocket og Dr. Zager flygter i deres helikopter, og ssværger at vende stærkt tilbage! Nu fokuserer Ash på sin forestående kamp i Nimbasa City-Salen, hvor han skal kæmpe mod Sal-lederen, Elesa!
