Da proa do luxuoso cruzeiro, Ash, Iris e Cilan vêem o que parece ser um Pokémon gigante em meio a neblina! Ninguém mais parece ter visto, então eles decidem perguntar na próxima parada, a Ilha do Grande Fantasmal, para ver se os moradores locais sabem de alguma coisa. Um comerciante diz a eles sobre um boato de terem visto um em uma pequena ilha vizinha, e eles imediatamente correm para lá para investigar antes que o homem possa dizer a eles que o boato era de 10 anos atrás. A pequena ilha parece ser um santuário Pokémon. Enquanto eles exploram a floresta, nossos heróis são ameaçados por um Heatmor gigante, que os leva para a beira de um penhasco! Ele também assusta vários Pokémon selvagens, incluindo um Foongus que ataca Axew com o Esporos numa tentativa frenética de fugir e o deixa num sono profundo!
Pikachu tenta revidar contra o enorme Pokémon, mas nenhum de seus ataques surte efeito. Então, uma pessoa misteriosa usando um casaco e óculos escuros aparece entre nossos heróis e o Heatmor gigante – e então os dois desaparecem! Cilan acha que eles estão lidando com ilusões, mas eles têm problemas maiores nas mãos. Axew ainda não acordou e eles precisam ir a um Centro Pokémon.
No caminho de volta a ilha principal, eles descobrem um Centro Pokémon abandonado escondido no meio da floresta, e seu saguão está repleto de Pokémon selvagens aguardando tratamento! Iris pede ajuda e um Audino que aparece e some e vem a Enfermeira Joy... que retorna sem Audino. Ash fica um pouco confuso com isso, porque a Enfermeia Joy e Audino sempre trabalham juntos. Como um outro sinal de que esse Centro Pokémon é um pouco incomum, a Enfermeira Joy faz um remédio para Axew moendo algumas frutas num pilão. Mas a moda antiga é eficaz, e Axew acorda cheio de energia!
Então a misteriosa figura de óculos aparece novamente e se apresenta – ela é uma antiga Enfermeira Joy que agora investiga Centros Pokémon. Ela diz que esse centro em particular, onde ela costumava trabalhar, deveria estar fechado porque não há Treinadores na ilha.
Então, ela acusa a Enfermeira Joy mais jovem de ser uma impostora!
A Enfermeira Joy mais jovem parece estar numa luz difusa, e nossos heróis vêem alguma coisa estranha: uma visão da Enfermeira Joy Investigadora de 10 anos atrás, trazendo um Zorua ferido para o Centro Pokémon.
Ela diz a nossos heróis que soltou Zorua na floresta após tratá-lo, mas ele sempre voltava para ajudá-la no centro. Os dois se tornaram bons amigos, mas depois o centro foi fechado, e Zorua parou de ir até lá, assim ela não teve como avisá-lo de que ela teve que partir.
Logo tudo ficou claro: a Enfermeira Joy que tratou de Axew e o Audino ajudante dela são Zoroak disfarçados!
Zoroak, que evoluiu do Zorua que a Enfermeria Joy salvou tem comandado o Centro Pokémon sozinho para ajudar todos os Pokémon Selvagens que vivem na ilha. A Enfermeira Joy fica tocada com isso, e se oferece para ficar e reabrir o Centro Pokémon oficialmente, assim ela e Zoroak podem cuidar dos Pokémon da ilha juntos. E depois de deixarem a casa toda limpa, uma cortesia de nossos heróis, o Centro Pokémon fica novinho em folha, e nossos heróis partem para a próxima aventura!