Tão rápido como Pikachu sofreu de uma misteriosa doença, que afetou todos seus movimentos tipo elétrico, uma segunda tempestade o curou completamente com a mesma rapidez! Atribuindo a provação às ações do Pokemon Lendário Zekrom, o Professor Carvalho e a Professora Juniper concordam que são necessárias novas pesquisas. Enquanto isso, a Equipe Rocket chega à Região de Unova, e prepara-se para lançar mão de uma operação projetada para roubarem Pikachu e Zekrom também. Ash também decidiu continuar sua jornada ali na Região de Unova e, assim, munido com um novo Pokédex e novas Pokébolas, nosso herói se propõe a reunir tantos Pokémon da Região de Unova quanto puder. No caminho, ele viaja com a Iris e o Pokémon dela, Axew, enquanto vê o primeiro Pokémon da Região de Unova, Pidove. Mas logo depois, a Equipe Rocket lança seu plano malígno, e rouba Pikachu, Pidove e Axew também! É claro, que sem cruzar os braços, Ash entra em ação, batalhando com seus velhos inimigos Jassie, James e Meowth, e com uma inesperada ajuda do tímido Pokémon Oshawott (que havia seguido Ash e Pikachu), Ash e o Pokémon de Iris, retornaram sãos e salvos, enquanto a Equipe Rocket desaparece misteriosamente. Após visitar o Centro Pokémon, onde Pikachu, Axew e Pidove recuperaram completamente a saúde graças a Enfermeira Joy, Iris tem de admitir que apesar das atitudes de Ash como “criancinha”, ela ficou impressionada com a maneira com que ele entrou em ação ao salvar os três Pokémon, enquanto Ash se pergunta, porque Oshawott os ajudou daquela maneira...