I Cynthias sommarhus i Undella Town, ägnar sig Ash, Iris och Cilan åt special-träning inför Pokémon World Tournament Junior Cup, men Dawn har bestämt att hon behöver en paus. Hon berättar för de andra om en närbelägen, öde ö där det bor en speciell Onix, och föreslår att de ska utforska den. Cynthias butler, Jervis, kör dem till ön med en båt och släpper av dem med löfte om att komma tillbaks innan middagen och med en olycksbådande varning om att vara mycket försiktiga på ön. De upptäcker snart varför: En enorm grotta på ön är hemvist för en stor flock Onix och dessa stora Pokémon är inte allt för glada över att ha fått besökare! De attackerar och våra hjältar flyr och kommer under tiden ifrån varandra. Iris och Dawn hamnar i ett skogsområde, och Piplup befinner sig i ett öppet område tillsammans Ash och Cilan. Killarna springer på ännu fler arga Onix när de försöker fly, och Meloetta träder fram för att driva bort dem, först genom att försöka lugna dem med sin vackra sång och när det inte fungerar, genom att ändra ”Forme” och börja strida!
Under tiden har Dawn och Iris lite otur med några Pokémon de träffar i skogen. Iris blir förtjust över att få se en Magnemite, eftersom hon aldrig sett någon förut, men när hon försöker klappa den, får hon en elektrisk stöt...och för Dawn går det lika illa när hon träffar en förtjusande, men giftig Foongus!
Tjejerna hittar till slut vägen in i en djup ravin och återförenas med Ash och Cilan, och Piplup, tillsammans med alla Onix som jagar dem! Oshawott och Piplup slår sig samman för att strida mot Onix, eftersom deras Vatten-typ-moves är super-effektiva, och under striden lär sig Oshawott att använda en ny kraftfull move, Hydro Pump! Men inte ens den är nog mot så många Onix, och Ash ropar till Meloetta att försöka sjunga igen. Det verkar inte hjälpa och Onix kommer allt närmare, men då, uppe på klippan ovanför, reser sig en Onix med annorlunda färg och ryter åt de andra. Det är den speciella Onix som våra hjältar har letat efter! Den verkar också vara chefen på ön, eftersom övriga Onix drar sig tillbaka och återvänder till sin grotta.
När Jervis kommer för att hämta dem, berättar Ash och de andra vad som hänt ,och Jervis förmodar att den speciella Onixen hjälpte dem att fly för att den blev rörd av Meloettas sång! När de är på väg tillbaka mot Undella Town, inspireras Meloetta av en vacker regnbåge och börjar sjunga igen, och alla, Iris, Dawn, Cilan, Ash och till och med Jervis, säger att Meloettas sång påminner dem om deras hem. Det verkar som om denna speciella Pokémons röst besitter en mystisk kraft...en som Team Rocket är ute efter att dra nytta av, och Jessie, James och Meowth jobbar mot nästa steg av sin ondskefulla plan, som går ut på att fånga Meloetta åt deras Boss!
