Våra hjältar har blivit inbjudna av Professor Juniper den äldre (Cedric) att följa med honom när han ska utforska en ruin, känd för att ha varit mötesplatsen för ”Hjälten” och Zekrom för länge sedan. Sedan läser Cedric upp en passage från del arton av den Svarta Kapitlet i Pokémon Mytologi: ” När Hjälten gör mörker till ljus och Hjältens hjärta blir ett med Pokémon, då ska Zekrom nedstiga och låna Hjälten sin kraft.”.
När de kommer till ruinen, varnar Cedric våra hjältar för att den kan vara fylld av fällor, och det upptäcker de ganska snart att den också är. Deras första incident involverar ett klippblock som rullar nerför en smal passage och hotar att mosa dem, men Pansage använder Dig och våra hjältar lyckas fly till säkerheten. Sedan möter de två broar som spänner över en djup klyfta, men det visar sig att BÅDA broarna är fyllda av faror. Men, Axew hittar en annan väg.
När de påträffar tre grottingångar, måste de bestämma vilken ingång som är den rätta. De provar en i taget och det visar sig att den tredje låter dem gå in i ett stort rum, som är format som en vulkanisk grott, och där upptäcker de flera stenpelare och Gyllene Mörk Sten.. och en ilsken Sigilyph! Trots att Cedric varnar våra hjältar för att röra stenen, så tar han den själv! Sen möter de flera ilskna Cofagrigus. När allt verkar kört, påminner Cedric dem om passagen i det Svarta kapitlet i Pokémon Mytologi: ”Zekrom lånar Hjälten sin kraft så snart hans hjärta blir ett med Pokémons”.
Medan Ash och hans vänner minns alla de underbara stunder de haft med sina Pokémon, och hur mycket de älskar dem, räddar Sigilyph och Cofagrigus plötsligt dem.
Även om Iris är arg över alla farorna som deras äventyr utsatt dem för, är Ash och Cilan extatiska över allt roligt de också haft. De tackar Cedric och bjuder sin nye vän farväl.
Plötsligt står en hotfull Krokorok framför dem…
