In het vakantiehuis van Cynthia in Undella Town zijn Ash, Iris en Cilan bezig met speciale training voor de Pokémon Wereldtoernooi Junior Cup, maar Dawn heeft besloten dat ze een pauze nodig heeft. Ze vertelt de anderen over een verlaten eiland in de buurt waar een bijzondere Onix leeft en stelt voor om daar eens te gaan kijken.
Cynthia’s butler Jervis brengt ze met de boot naar het eiland en zet ze daar af met de belofte om voor het eten terug te komen. Hij geeft ze een onheilspellende waarschuwing om heel voorzichtig te zijn op het eiland.
Ze ontdekken al snel waarom: in een enorme grot op het eiland blijkt een grote groep Onix te leven en de gigantische Pokémon zijn niet bepaald blij met bezoek! Ze vallen aan en onze helden vluchten, waarbij ze elkaar kwijt raken. Iris en Dawn duiken op in een bebost gebied en Piplup bevindt zich op een open plek met Ash en Cilan. De jongens komen nog meer kwade Onix tegen terwijl ze proberen te ontsnappen en Meloetta komt tussenbeide om ze weg te jagen, eerst door te proberen ze te kalmeren met haar prachtige lied en wanneer dat niet werkt, door haar Vorm te veranderen en te gaan vechten.
Ondertussen hebben Dawn en Iris pech met de Pokémon die ze in het bos tegenkomen. Iris is dolblij als ze een Magnemite ontmoet, omdat ze die nog nooit eerder heeft gezien en krijgt een schok als ze hem probeert te aaien. Dawn heeft een soortgelijke ervaring met een schattige maar giftig Foongus. De meiden vinden uiteindelijk de weg naar het ravijn en daar zien ze Ash, Cilan en Piplup weer, samen met de groep Onix die hen achterna zit. Oshawott en Piplup vormen een team tegen de Onix omdat Watersoort aanvallen super effectief zijn en tijdens dit gevecht leert Oshawott hoe hij de krachtige Hydro Pomp moet gebruiken. Maar zelfs dat is niet genoeg tegen zoveel Onix en Ash vraagt Meloetta om weer te gaan zingen. Het lijkt niet te werken en de Onix komen steeds dichterbij, maar dan, vanaf een hoger gelegen klif, verschijnt er een Onix met een andere kleur die tegen de anderen brult. Het is de bijzondere Glimmende Onix waar onze helden naar op zoek waren. Hij blijkt ook de baas te zijn van het eiland als de andere Onix achteruit gaan en terugkeren naar hun grot. Als Jervis ze weer komt ophalen vertellen Ash en de anderen wat er is gebeurd en suggereert hij dat de Glimmende Onix hen heeft helpen ontsnappen omdat hij was geraakt door het gezang van Meloetta. Op de terugweg naar Undella Town inspireert een schitterende regenboog Meloetta om weer te zingen en iedereen, Iris, Dawn, Cilan, Ash en zelfs Jervis merken op dat het lied van Meloetta hen doet denken aan thuis. Het lijkt erop dat de stem van de bijzondere Pokémon een mysterieuze kracht bezit… een waar Team Rocket naar op zoek is om gebruik van te maken. Jessie, James en Meowth werken aan de volgende stap van hun schurkachtige plan om Meloetta voor de Baas te vangen!
