Auf der Schiffsreise zu den Weißen Ruinen und Professor Esches Vater, Eberhard, lernen unsere Helden einen ungewöhnlichen jungen Mann kennen, der sich N nennt. N betrachtet alle Pokémon als seine Freunde und behauptet, dass er die innere Stimme der Pokémon hören kann. Als er sieht, was für eine enge Bindung Ash und Pikachu haben, freut ihn das sehr. Aber als Ash erwähnt, dass sie auf dem Weg zu Nachforschungen über das Legendäre Pokémon Reshiram sind, scheint N das so sehr zu interessieren, dass Ash ihm auch von seiner Begegnung mit Zekrom erzählt. Daraufhin ist N nicht mehr zu bremsen. Er setzt zu einer leidenschaftlichen Beschreibung seiner Ziele an: Er will alles über das Geheimnis erfahren, wieso Pokémon auf dieser Welt existieren, er möchte Reshiram und Zekrom treffen und das Leben der Pokémon verbessern. Das klingt in Ashs Ohren gut, aber schnell wird ihm klar, dass er und N nicht in jedem Punkt einer Meinung sind. Denn N lehnt Pokémon-Kämpfe vollkommen ab! Ihm gefällt es nicht, dass Freunde dazu gezwungen werden, gegeneinander zu kämpfen.

Währenddessen verfolgt Team Rocket wieder einmal seinen finsteren Plan, Pikachu für den Boss zu fangen. Während Ash und Lilia einen Übungskampf austragen, locken sie deshalb Milza von unseren Helden weg. Pikachu folgt ihm, wie zu erwarten war, und schon kurz darauf befindet sich Pikachu in den Fängen von Team Rocket. Aber mir der Hilfe von N kann Ashs bester Kumpel schnell wieder befreit werden, doch eine Attacke von James` Hutsassa hat das arme Pikachu vergiftet. Ash weiß nicht, was er tun soll, doch N hat sofort einen Plan: Er bringt alle zum Bug des Schiffes und ruft seine Freunde, zwei wilde Mamolida, die daraufhin aus dem Wasser springen und Heilung einsetzen! Im Handumdrehen ist Pikachu wieder gesund! Kurze Zeit später legt das Schiff in Stratos City an. N geht von Bord, aber er versichert unseren Helden, dass sie sich wiedersehen werden. Als er sich vom Schiff entfernt, denkt N darüber nach, was das Treffen mit Zekrom vor einiger Zeit für Ash zu bedeuten haben könnte… Es verspricht auf jeden Fall eine lebensverändernde Erfahrung zu werden…